Seurantatuloksista 2000-luvulla julkaistua

Tähän on koottuna vuodesta 2000 lähtien valmistuneita ympäristön seurantaa käsitteleviä pääosin painettuja julkaisuja, joiden laadintaan Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen (PKA) henkilöstöä on osallistunut.

• Artikkelit tieteellisissä sarjoissa (peer-review referoidut)
• Kotimaiset sarjajulkaisut
• Kokousjulkaisut
• Tiivistelmät kokousjulkaisuissa
• Muut julkaisut, artikkelit ammattilehdissä ja lehtikirjoitukset
• Toimitustyöt

Artikkelit tieteellisissä sarjoissa (peer-review referoidut)

2009

• Laurén, A., Heinonen, J., Koivusalo, H., Sarkkola, S., Tattari, S., Mattsson, T., Ahtiainen, M., Joensuu, S., Kokkonen, T. & Finér, L. 2009.  Implications of Uncertainty in a Pre-treatment Dataset when Estimating Treatment Effects in Paired Catchment Studies: Phosphorus Loads from Forest Clear-cuts. Water, air and soil pollution 196 (1-4): 251-261.

2008

• Holopainen, A-L, Lepistö, L., Niinioja, R. & Rämö, A. 2008. Spatiotemporal and long-term variation in phytoplankton communities in the oligotrophic Lake Pyhäjärvi on the Finnish-Russian boarder. Hydrobiologia 599: 135-141.

2006

• Koivusalo, H., Kokkonen, T., Laurén, A., Ahtiainen, M., Karvonen, T., Mannerkoski, H., Penttinen, S., Seuna, P., Starr, M. & Finér, L. 2006. Parametrisation and application of a hillslope hydrological model to assess impacts of forest clear-cutting on runoff generation. Environmental Modelling and Software 21: 1324-1339.
  
• Kortelainen, P., Mattsson, T., Finer, L., Ahtiainen, M., Saukkonen, S. & Sallantaus, T. 2006. Controls on the export of C, N, P and Fe from undisturbed boreal catchments, Finland. Aquat. Sci. 68 (2006) 453-468.
  
• Kukkonen, M., Simola, H., Niinioja, R. & Luotonen, H. 2006. Diatoms as indicators of the ecological state at the present and in the past in Karelian Pyhäjärvi - an oligotrophic transboundary lake on the Finnish - Russian border. Verh. Int. Verein. Limnol. 29: 1976-1980.

2005 

• Niinioja, R., Holopainen, A.-L., Lepistö, L., Kukkonen, M., Rämö, A. & Mononen, P. 2005. An overview of the state of two large lakes in North Karelia, Finland. Verh. Int. Verein. Limnol. 29: 399–402.

2004

• Lepistö, L., Holopainen, A-L. & Vuoristo, H. 2004. Type ­specific and indicator taxa of phytoplankton as quality ­criterion for assessing the ecological status of Finnish boreal lakes. Limnologica 34: 236-248.
• Niinioja, R., Holopainen, A-L., Lepistö, L., Rämö, A. & Turkka, J. 2004. Public participation in monitoring programmes as a tool for lakeshore monitoring: the example of Lake ­Pyhäjärvi, Karelia, Eastern Finland. ­Limnologica 34: 154-159.

2003

• Holopainen, A-L., Niinioja, R. & Rämö, A. 2003. Seasonal succession, vertical distribution and long term variation of phytoplankton communities in two shallow forest lakes in eastern Finland. Hydrobiologia 506-509:237-245.
• Hämäläinen, H, Luotonen, H., Koskenniemi, E. & Liljaniemi, P. 2003. Inter-annual variation in macroinvertebrate ­communities in a shallow forest lake in eastern Finland during 1990-2001. Hydrobiologia 506-509: 389-397.
• Lepistö, L. & Holopainen, A.-L. 2003. Occurrence of ­Cryptophyceae in boreal lakes. Hydrobiologia 502 (1-3): 307-314.
• Niinioja R., Holopainen, A-L., Hämäläinen, H., Heitto, L., Luotonen, H., Mononen, P. & Rämö, A. 2003. State of Lake Sysmäjärvi, Eastern Finland, after loading with mine water and municipal waste water for several decades. Hydrobiologia 506-509: 773-780.

2002

• Liljaniemi, P., Vuori, K-M., Ilyashuk, B. & Luotonen, H. 2002. Habitat characteristics and macroinvertebrate assemblages in headwater streams: relations to catchment silvicultural activities. Hydrobiologia 474: 239-251.
• Niinioja, R., Holopainen, A.-L. & Rämö, A. 2002. Seasonal water quality variations in two pristine headwater lakes, boreal coniferous forest area, eastern Finland. Verh. Int. Ver. Limnol. 28: 492-496.

2000

• Niinioja, R., Holopainen, A.-L., Huttula, T., Sipura, J., Rämö, A. & Mononen, P. 2000. Water chemistry, phytoplankton and hydrodynamics in Lake Pielinen, Eastern Finland. Verh. Int. Ver. Limnol. 27: 2212-2217.

Kotimaiset sarjajulkaisut

2009

• Huttula, T., Bilaletdin, E.,  Härmä, P., Kallio, K., Linjama, J.,  Lehtinen, K., Luotonen, H., Malve, O., Vehviläinen, B. ja  Villa, L. 2009. Ympäristön seurannan menetelmien kehittäminen. Automatisointi ja muut uudet mahdollisuudet. Suomen ympäristökeskuksen raportteja 13/2009. 73 s. Suomen ympäristökeskus. Julkaisu on saatavana ainoastaan sähköisesti.

2007

• Starr, M., Forsius, M., Hatakka, T., Niinioja, R., Ruoho-Airola, T.,  Ukonmaanaho, L. &  Vuorenmaa, J.  2007. Hietajärvi - long-term results from a Finnish ICP Integrated Monitoring (IM) catchment. Hietajärvi - pitkäaikaisen seurannan tuloksia ICP Yhdennetty ympäristön seurannan (YYS) valuma-alueelta. Julk.: Merilä, P., Kilponen, T. & Derome, J. (eds), Forest condition monitoring in Finland - National Report 2002-2005. Working Papers of the Finnish Forest Research Institute. 45: 147-166. In English with Finnish abstract.

2006

• Holopainen, A.-L., Niinioja, R. ja Rämö, A. 2006. Hietajärven kasviplanktonyhteisössä tapahtuneet muutokset. Julk.: Niinioja, R. ja Rämö, A. (toim.), Hietajärven alue – ympäristön seurannan helmi Pohjois-Karjalassa. Suomen ympäristö 59: 47-51.
• Kleemola, S. ja Rämö, A. 2006. Hietajärven alueen kuvaus. Julk.: Niinioja, R. ja Rämö, A. (toim.), Hietajärven alue – ympäristön seurannan helmi Pohjois-Karjalassa. Suomen ympäristö 59: 15.
• Luotonen, H., Hämäläinen, H., Liljaniemi, P. ja Koskenniemi, E. 2006. Hietajärven pohjaeläinyhteisöjen tila ja yhteisöjen pitkän aikavälin muutokset. Pohjaeläimet. Julk.: Niinioja, R. ja Rämö, A. (toim.), Hietajärven alue - ympäristön seurannan helmi Pohjois-Karjalassa. Suomen ympäristö 59: 52-54.
• Mattsson, T., Finér, L., Kenttämies, K., Ahtiainen, M., Haapanen, M. ja Lepistö, A. 2006. Avohakkuun vaikutus fosforin, typen ja kiintoaineen huuhtoumiin; raportti VALU -tutkimushankkeen ja Siuntion Rudbäckin alueiden tutkimuksista. Julk.: Kenttämies, K. ja Haapanen, M. (toim.), Metsätalouden vesistökuormitus. MESUVE-hankkeen loppuraportti. Suomen ympäristö 816: 63-70.
• Mattsson, T., Ahtiainen, M., Kenttämies, K. ja Haapanen, M. 2006. Avohakkuun ja ojituksen pitkäaikaisvaikutukset valuma-alueen ravinne- ja kiintoainehuuhtoumiin. Julk.: Kenttämies, K. ja Haapanen, M. (toim.), Metsätalouden vesistökuormitus. MESUVE-hankkeen loppuraportti. Suomen ympäristö 816: 73-81.
• Niinioja, R., Höytämö, J. ja Rämö, A. 2006. Hietajärven alueen hydrologiset olot ja veden laatu. Julk.: Niinioja, R. ja Rämö, A. (toim.), Hietajärven alue - ympäristön seurannan helmi Pohjois-Karjalassa. Suomen ympäristö 59: 38-46.

2005

• Kukkonen, M., Kiiski, J., Luotonen, H. & Niinioja, R. 2005. The plan of water and water ecosystem protection for Lake Karelian Pyhäjärvi. Alueelliset ympäristöjulkaisut 375. 53 pp.
• Luotonen, H., Karttunen, K., Lyytikäinen, V., Kotanen, J. ja Niinioja, R. 2005. Vesikasvillisuus niukkaravinteisen ja kirkasvetisen Karjalan Pyhäjärven ekologisen tilan ilmentäjänä. Alueelliset ympäristöjulkaisut 378. 68 s.
• Luotonen, H., Tolonen, K., Kotanen, J., Hokkanen, H., Niinioja, R., Rhyabinkin, A., Litvinenko, A. ja Kalmikov, M. 2005. Rantavyöhykkeen pohjaeläimistö kirkasvetisen Karjalan Pyhäjärven tilan ilmentäjänä. Rajavesien ekologisen tilan arviointi hanke. Alueelliset ympäristöjulkaisut 377. 44 s.
• Rask, M., Luotonen, H. ja Lyytikäinen, V. (toim.) 2005. Kalasto niukkaravinteiden ja kirkasvetisen Karjalan Pyhäjärven ekologisen tilan ilmentäjänä. Rajavesien ekologisen tilan arviointi -hanke. ­Alueelliset ympäristöjulkaisut 391. 52 s.

2004

• Forsius, M., Hatakka, T., Kleemola, S., Niinioja, R., Ruoho-Airola, T., Starr, M., Ukonmaanaho, L., eli YYS-työryhmä sekä Arvola. L., Keskitalo, J. ja Rask, M. 2004. Selvitys Yhdennetyn seurannan kansallisen ohjelman toiminnasta seurantakaudella 2001-2004. Suomen ympäristökeskuksen moniste 308. 29 s.
• Holopainen, A-L., Lepistö, L., Niinioja, R., Sharov, A. ja Rämö, A. 2004. Karjalan Pyhäjärven kasviplanktonin biomassa ja lajisto. Rajavesien ekologisen tilan arviointi -hanke. Alueelliset ympäristöjulkaisut 357. Pohjois-Karjalan ympäristökeskus. 36 s.
• Niinioja, R., Rämö, A. ja Holopainen, A.-L. 2004. Päällyslevästön eli perifytonlevästön tutkimukset Karjalan Pyhä­järvellä ja Ätäsköllä 1980- ja 1990-luvulla. Alueelliset ympäristöjulkaisut 357: 33-45.
• Niinioja, R. ja Turkka, J. 2004. Kansalaisten oma-aloitteinen vesistön tilan seuranta: esimerkki Karjalan Pyhäjärven ja Ätäskön näkösyvyysmittauksista. LifeVuoksi projektiin kirjoitettu muistio 28.11.2002. Julk.: Sandman, O., Airaksinen, O., Hokkanen, T., Kokko, M., Liikanen, P., Lähteenmäki, R., Mäkinen, H. ja Sojakka, P.. Paikallisten asukkaiden ja viranomaisten yhteistyö järvien tilan hoidossa ja seurannassa. Life Vuoksi -projektin kokemukset. Etelä-Savon ympäristökeskuksen moniste 56: 47-49.

2003

• Kukkonen, M., Kiiski, J., Luotonen, H. ja Niinioja, R. 2003. Karjalan Pyhäjärven vesien- ja vesiluonnonsuojeluohjelma. Alueelliset ympäristöjulkaisut 319. 90 s.
• Lepistö, L., Jokipii, R., Niemelä, M., Vuoristo, H., Holopainen, A.-L., Niinioja, R., Hammar, T., Kauppi, M. ja Kivinen, J. 2003. Kasviplankton järvien ekologisen tilan kuvaajana. Vuoksen vesistöalueen vuosien 1963 - 1999 seuranta-aineiston käyttö arvioinnissa ja luokittelussa. Suomen ympäristö 600. 80 s.
• Niinioja, R., Hämäläinen, H., Holopainen, A.-L., Luotonen, H. & Rämö, A. 2003. Monitoring of biota and water quality in small forest lakes within the IM programme. In: Kleemola, S. & Forsius, M. (eds.), 12th Annual Report 2003. UN ECE ICP Integrated Monitoring. Finnish Environment 637: 48-54.
• Ottoila, E. 2003. Pohjois-Karjalan jätesuunnitelman arviointi. Alueelliset ympäristöjulkaisut 291. 67 s.

2002

• Vuori, K.-M. 2002. Vesisammal- ja vesiperhosmenetelmät jokivesistöjen haitallisten aineiden riskinarvioinnissa ja seurannassa. Suomen ympäristö 571. 89 s.
• Vuori, K-M., Kotanen, J., Hammar, T., Heinonen, P., Herve, S., Kanninen, A., Kauppi, M., Koskinen, M., Manninen, P., Niinioja, R., Pietiläinen, O-P., Törrönen, J. & Vaskinen, E. 2002. Vesistöjen ekologisen tilan arviointi ja seuranta. Vesipolitiikan puitedirektiivin toimeenpanon testaus Vuoksen vesistöalueella. Joensuu, Pohjois-Karjalan ympäristökeskus. Suomen ympäristö 557. 69 s.

2001

• Luotonen, H. 2001. Vesistöjen biologinen seuranta Suomessa ja seurantojen kehittämistarpeet. Julk.: Niinioja, R. & Haimi, P. (toim.) 2001. Ympäristön tilan seurannan kehittäminen Karjalan tasavallassa. Esitelmät syksyn 2000 tilaisuuksista. Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen monisteita 26: 34-45 ja168-177. (Venäjän- ja suomenkielinen.)
• Niinioja, R. 2001. Kajoonjärven valuma-alueen järvet. Metsätaloustoimenpiteet ja kuormitus sekä veden laatu 1970-luvulta vuoteen 2000. Joensuu, Pohjois-Karjalan ympäristökeskus. Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen monisteita 27. 48 s.
• Niinioja, R., Luotonen, H. & Ottoila, E. 2001. Alueellinen ympäristön seuranta ja Pohjois-Karjalan ympäristökeskus. Julk.: Niinioja, R. & Haimi, P. (toim.) 2001. Ympäristön tilan seurannan kehittäminen Karjalan tasavallassa. Esitelmät syksyn 2000 tilaisuuksista. Pohjois Karjalan ympäristökeskuksen monisteita nro 26: 73-78 ja 191-195. (Venäjän- ja suomenkielinen).
• Niinioja, R., Sandman, O., Turkia, J., Huttunen, P. & Tossavainen, T. 2001. Metsätaloustoimenpiteiden vaikutukset Kajoonjärvessä ja Kuohattijärvessä. Alueelliset ympäristöjulkaisut 246. 50 s.

Kokousjulkaisut

2006

• Holopainen, A-L., Huuskonen, H., Leppä, M., Rahkola-Sorsa, M., Ruuska ja Väisänen, P. 2006. Tehostuneen jätevesien puhdistuksen vaikutukset Pielisjoen ja Pyhäselän vedenlaatuun ja vesibiologiaan. Julk.: Simola H. (toim.), Suurjärviseminaari 2006. Joensuun yliopisto, Karjalan tutkimuslaitoksen julkaisuja 145: 175–180.
• Niinioja, R., Holopainen, A.-L., Lepistö L., Päiväläinen, P.,Rämö, A., Mononen, P., Hammar, T. ja Kivinen, J. 2006. Pohjois-­Karjalan suurten järvien vedenlaatu ja kasvi­plankton - pitkäaikaisseurannan tuloksia. Julk.: Simola H. (toim.), Suurjärvi­seminaari 2006. Joensuun yliopisto, Karjalan tutkimuslaitoksen julkaisuja 145: 160–168.

2005

• Kukkonen, M., Puustinen, M., Niinioja, R., Eskelinen, J. & Turtola, E. 2005. Long-term studies of erosion and phosphorus load under different cultivation methods in three experimental fields in Finland. In: Heckrath, G., Bechmann, M. Ekholm, P., Djodjic, F., Ulén, B., Andersen, H. E. and Olsen, P. (eds),Tools for Assessing Phosphorus Loss from Nordic Agriculture. TemaNord 2005: 583, p. 121–122.
• Saari, P., Saarnio, S., Lyytikäinen, V., Luotonen, H. & Alm, J. 2005. Dynamics of vegetation, carbon and nitrogen as indicators of the function of peatland buffers. In: Meriläinen P., Sivula, L. & Oikari A. (eds). Seventh ­Finnish Conference of Environmental Sciences. Proceedings. University of Jyväskylä, p. 215-217.

2004

• Höytämö, J., Rämö, A. & Niinioja, R. 2004. The runoff in two pristine forest brooks in Hietajärvi catchment, Eastern Finland. In: Järvet, A. (ed.) XXIII Nordic Hydrological Conference, Tallinn, Estonia, 8-12 August, 2004. Selected articles, Nordic Hydrological Programme. NHP Report No. 48, Vol. I: 286-292.
• Niinioja, R., Höytämö, J. & Rämö, A. 2004. Colour, pH and phosphorus variations and phosphorus leaching of two pristine brooks in a forested catchment, Eastern Finland. In: Järvet, A. (ed.), XXIII Nordic Hydrological Conference, Tallinn, Estonia, 8-12 August, 2004. Selected articles. Nordic Hydrological Programme, NHP Report No. 48, ­Vol. I: 277-285.

2003

• Ahtiainen, M., Finér, L., Haapanen, M., Kenttämies, K., Mattsson, T. ja Rämö, A. 2003. Näkyvätkö hakkuun ja maanmuokkauksen vaikutukset valumaveden laadussa - tehoavatko ympäristönsuojelu-ohjeet? Julk.: Finér, L., Laurén, A.& Karvinen, L. (toim.), Ajankohtaista metsätalouden ympäristökuormituksesta. Tutkimustietoa ja työkaluja -seminaari, Kolin luontokeskus Ukko 23.9.2002. Metsäntutkimuslaitoksen tiedonantoja 886:25-33.
• Holopainen, A.-L., Niinioja, R. & Lepistö, L. 2003. Phytoplankton as an indicator of ecological state of the oligotrophic transboundary Lake Karelian Pyhäjärvi on the Finnish-Russian border. In: Ruoppa M., Heinonen P., Pilke A., Rekolainen S. Toivonen H. & Vuoristo H. (eds), How to asses and monitor ecological quality in ­freshwaters. Copenhagen, Nordic Council of Ministers. TemaNord 2003:547: 146-149.
• Kukkonen, M., Simola, H., Niinioja, R. & Luotonen, H. 2003. Diatoms as indicators of the ecological state at the present and in the past in Karelian Pyhäjärvi - an oligotrophic transboundary lake on the Finnish-Russian Border. In: Ruoppa M., Heinonen P., Pilke A., Rekolainen S., Toivonen H. & Vuoristo H. (eds), How to asses and monitor ecological quality in freshwaters. Copenhagen, Nordic Council of Ministers. TemaNord 2003:547: 136-140.
• Luotonen, H., Karttunen, K., Niinioja, R. & Kotanen, J. 2003. Macrophytes as an indicator of the ecological status of an oligotrophic lake – as an example the transboundary Lake Karelian Pyhäjärvi on the Finnish-Russian border area. In: Ruoppa M., Heinonen P., Pilke A., Rekolainen S., Toivonen H. & Vuoristo H. (eds), How to asses and monitor ­ecological quality in freshwaters. Copenhagen, Nordic Council of Ministers. TemaNord 2003:547: 131-135.
• Niinioja, R. & Turkka, J. 2003. Transparency measurements - a tool for environmental monitoring? An example from Lakes Pyhäjärvi and Ätäskö, Finland. In: Simola, H., Terzhevik, A. Yu., Viljanen, M. & Holopainen, I. J. (eds) Proceedings of the Fourth International Lake Ladoga Symposium. University of Joensuu, Publ. of Karelian Res. Inst. 138: 393-399.
• Niinioja, R., Sandman, O., Turkia, J., Huttunen, P. & Tossavainen, T. 2003. Metsätaloustoimenpiteiden vaikutukset vesistöissä: kaksi esimerkkijärveä Pohjois-Karjalassa. Julk.: Finér, L., Laurén, A.& Karvinen, L. (toim.), Ajankohtaista metsätalouden ympäristökuormituksesta. Tutkimus­tietoa ja työkaluja -seminaari, Kolin luontokeskus Ukko 23.9.2002. Metsäntutkimus­laitoksen tiedonantoja 886: 101-106.

2002

• Airaksinen, O., Bäck, S, Luotonen, H., Kanninen, A., Karttunen, K., Niinioja, R., Sandman, O., Servomaa, K., Sojakka, P., Ustinov, A. & Valta-Hulkkonen, K. 2002. Role of the littoral area as a part of an optimal model for environmental monitoring and the involvement of local people - Presentation of the LIFE Vuoksi project. In: Haunia, S. (ed.) Good ecological status: Reference conditions for surface waters. Eigth scientific and technical review - EurAqua. Proceedings. 24-25 October 2001, Finnish Environment Institute, SYKE, Helsinki. pp. 55-57.
• Hämäläinen, H., Koskenniemi, E., Kotanen, J., Heino, J., Paavola, R. & Muotka, T. 2002. Benthic invertebrates and the implementation of WFD: sketches from Finnish rivers. In: Ruoppa M. & Karttunen, K. (eds) Typology and ecological classification of lakes and rivers. TemaNord 2002:566: 55-58.
• Kukkonen, M., Pajunen, H., Kortelainen, P. & Niinioja, R. 2002. How to find the past conditions of a lake? Paleolimnology. Abstract in: Ruoppa, M. & Karttunen, K. (eds), Typology and ecological classification of lakes and rivers. TemaNord 2002, 566: 91-92.
• Luotonen, H., Niinioja, R., Karttunen, K., Rask, M. & Viljanen, M. 2002. Transboundary Lake Karelian Pyhäjärvi on the Finnish - Russian Border Area - Assessment of the Ecological Status. In: Ruoppa, M. & Karttunen, K. (eds), Typology and ecological classification of lakes and rivers. TemaNord 2002, 566: 98-101.

2001

• Kukkonen, M., Pajunen, H., Kortelainen, P. & Niinioja, R. 2001. Suomalaisten suurjärvien jaottelu pintasedimentin piilevien avulla. Abstract: Monitoring of large Finnish lakes with diatoms. Julk.: Grönlund, E., Viljanen, M., Juvonen, P, & Holopainen, I. J. (toim.), Suurjärviseminaari 2001. Ympäristö ja yhteiskunta, Joensuun yliopisto. Karjalan tutkimuslaitoksen julkaisuja n:o 133: 252-253.
• Niinioja, R., Luotonen, H., Mononen, P., Holopainen, A.-L. & Hämäläinen, H. 2001. Pohjois-Karjalan suurjärvien seurannan ja velvoitetarkkailujen kehittäminen: vesipuitedirektiivin näkökulma. Abstract: How to develop monitoring and statutory monitoring of large lakes in North Karelia - needs of EU Water Framework Directive. Julk.: Grönlund, E., Viljanen, M., Juvonen, P, & Holopainen, I. J. (toim.), Suurjärviseminaari 2001. Ympäristö ja yhteiskunta, Joensuun yliopisto. Karjalan tutkimus­laitoksen julkaisuja n:o 133: 254-263.

2000

• Hakalisto, S. 2000. Kolin luonnon valtaisa vaihtelevuus. - Julk.: Lovén, L. & Rainio, H. (toim.), Kolin perintö. s. 56 - 59. Metsäntutkimuslaitos ja Geologinen tutkimuskeskus.

Tiivistelmät kokousjulkaisuissa

2009

• Niinioja, R., Holopainen, A.-L. & Rämö, A. 2009. Monitoring of algae – examples from large lakes in North Karelia, Eastern Finland. In: 2^nd European Large Lakes Symposium, 10-14 August, 2009, Norrtälje, Sweden.Programme and Abstracts, P. 51.
• Niinioja, R., Rämö, A. & Alm, J. 2009. Changes in oxygen concentration in two small pristine boreal lakes, North Karelia, Finland. In: Ukonmaanaho, Liisa, Nieminen, Tiina M. & Starr, Mike (eds.), 6th International Symposium on Ecosystem Behaviour BIOGEOMON 2009 Conference Programme & Abstracts. Metlan työraportteja / Working Papers of the Finnish Forest Research Institute 128: 70.
• Niinioja, R., Holopainen, A.-L., Lepistö, L., Rämö, A., Mononen, P., Kukkonen, M., Hammar, T., Sojakka, P. & Alm, J. 2009. Can trends and short term changes in water quality and phytoplankton of large lakes be explained by land use, point source load and climate? In: Ukonmaanaho, Liisa, Nieminen, Tiina M. & Starr, Mike (eds.),  6th International Symposium on Ecosystem Behaviour BIOGEOMON 2009 Conference Programme & Abstracts. Metlan työraportteja / Working Papers of the Finnish Forest Research Institute 128: 69.
• Niinioja, R., Holopainen, A.-L., Lepistö, L., Rämö, A., Mononen, P., Kukkonen, M. & Alm, J. 2009. Trends and short term changes in large lakes in Eastern Finland. In: 2^nd European Large Lakes Symposium,  10-14 August, 2009, Norrtälje, Sweden. Programme and Abstracts, P. 10.
• Rantakari, M., Mattsson, T., Kortelainen, P., Piirainen, S., Finér, L. & Ahtiainen, M. 2009. Organic and inorganic carbon concentrations and fluxes from managed and unmanaged boreal first order catchments.  In: Ukonmaanaho, Liisa, Nieminen, Tiina M. & Starr, Mike (eds.), 6th International Symposium on Ecosystem Behaviour BIOGEOMON 2009 Conference Programme & Abstracts. Metlan työraportteja / Working Papers of the Finnish Forest Research Institute 128: 265.
• Ruoho-Airola, T., Hatakka, T., Lindroos, A.-J., Niinioja, R., Starr, M., Ukonmaanaho, L. & Vuorenmaa, J. 2009. How important is climate variability in determining the fate of N deposition in a remote Finnish forested catchment? In: Ukonmaanaho, Liisa, Nieminen, Tiina M. & Starr, Mike (eds.), 6th International Symposium on Ecosystem Behaviour BIOGEOMON 2009 Conference Programme & Abstracts. Metlan työraportteja / Working Papers of the Finnish Forest Research Institute 128: 77.

2008

• Niinioja, R., Rämö, A. & Holopainen, A.-L. 2008. Long-term winter water quality in small lakes in North Karelia, Finland. In: First International Symposium of Winter Limnology 2008, Programme and Abstracts, May 24-28, 2008, Kilpisjärvi Biological Station, Kilpisjärvi, Finland. p. 11.

2007

• Kortelainen, P., Mattsson, T., Finer, L., Ahtiainen, M. & Saukkonen, S. 2007. Controls on the export of TOC, N, P and Fe from undisturbed boreal catchments. In: SIL 2007 Abstracts CD: 30th Congress of the International Association of Theoretical and Applied Limnology, August 12-18, 2007, Montréal, Quebec, Canada. Montréal, SIL. SS27. [CD-ROM].

2006

• Hammar, T., Kanninen, A. ja Niinioja, R. 2006. Esimerkkejä pohjanläheisen happitilanteen kehityksestä ja taustatekijöistä Pohjois-Savon suurissa järvissä. Julk.: Joensuun yliopisto, Suurjärviseminaari 2006, tiivistelmät. s. 27.
• Holopainen, A-L., Huuskonen, H., Leppä, M., Rahkola-Sorsa, M., Ruuska, M. ja Väisänen, P. 2006. Tehostuneen jätevesien ­puhdistuksen vaikutukset Pielisjoen ja Pyhäselän vedenlaatuun ja vesibiologiaan. Julk.: Joensuun yliopisto, Suurjärvi­seminaari 2006, tiivistelmät. s. 28.
• Niinioja, R., Holopainen, A.-L., Lepistö L., Päiväläinen, P., Rämö, A., Mononen, P., Hammar, T. ja Kivinen, J. 2006. Pohjois-­Karjalan suurten järvien vedenlaatu ja kasvi­plankton pitkäaikaisseurannassa. Julk.: Joensuun yliopisto, Suurjärviseminaari 2006, tiivistelmät. s. 36.

2005

• Niinioja, R., Kontkanen, H., Hakalisto, S., Holopainen, A.-L. & Rämö, A. 2005. Monitoring of valuable bird sanctuaries in North Karelia, Eastern Finland. In: Book of abstracts, Shallow Lakes 2005, June 5-9, Dalfsen, The Netherlands. p. 92–93.

2004

• Ahtiainen, M., Haapanen, M., Kenttämies, K., Mattsson, T., Rämö, A., Huttunen, P. & Seuna, P. 2004. The long-term effects on runoff water characteristics from catchments of forest felling and drainage. Abstract XXIX Congress Lahti Finland 8-14 ­August 2004. Book of abstracts. p. 402.
• Niinioja, R., Luotonen, H., Mononen, P., Holopainen, A.-L. & Rämö, A. 2004. An overview of the state of large lakes in North Karelia, Finland. Abstract XXIX Congress Lahti Finland 8-14 August 2004. Book of abstracts. p. 393.

2003

• Kukkonen, M., Simola, H., Niinioja, R. & Luotonen, H. 2003. Long term monitoring and short-core studies of sedimentary ­diatoms of Karelian Pyhäjärvi, a ­trans-boundary lake between Finland and Russia. In: Sorvari, S., Salonen, V.-P., Korhola, A. & Ojala, A. (eds) 2003. 9th International Paleolimnology Symposium, ­August 24-28, Espoo, Finland. Abstract Volume.
• Niinioja, R., Holopainen, A.-L., Rämö, A. & Turkka, J. 2003. Algen- und Wassertranparenz-messungen als Mittel des Seeufer-Monitoring. Ein Beispiel des karelischen Sees Pyhäjärvi in Ostfinnland. Monitoring of algae and transparency measurements – tools for lakeshore monitoring? An example from Lake Pyhäjärvi, Eastern Finland. In: Proceedings of the Seeufer2003/ Lakeshores2003 Internationale Tagung / Conference, Konstanz / Bodensee, 19-21 Juni 2003, Deutschland / Germany. p. 73.

2002

• Holopainen, A.-L., Niinioja, R. & Rämö, A. 2002. Seasonal succession, vertical distribution and long term variation of phytoplankton communities in two shallow forest lakes in eastern Finland. Poster presentation. Abstract in: Padisak, J. (ed.), Shallow Lakes 2002, International Conference on Limnology of Shallow Lakes, Balatonfüred, Hungary, 25-30 May 2002, Abstracts, Veszprem University Press, p. 84.
• Lepistö, L., Holopainen, A.-L. & Rissanen, J. 2002. Classification of Finnish lakes using phytoplankton quantity and ­composition - a preliminary study. In: Ruoppa, M & Karttunen, K. (eds), Typology and ecological classification of lakes and rivers. ­TemaNord 2002: 566: 97.
• Luotonen, H., Hämäläinen, H., , Liljaniemi, P. Koskenniemi, E.& Niinioja, R. 2002. Inter-annual variation in macroinvertebrate communities in a shallow forest lake in eastern Finland during 1990-2001. Abstract in: Padisak, J. (ed.), Shallow Lakes 2002, International Conference on Limnology of Shallow Lakes, Balatonfüred, Hungary, 25-30 May 2002, Abstracts, Veszprem University Press, p. 150
• Miettinen, J., Hämäläinen, H. & Simola, H. 2002. Palaeolimnological analyses in the assessment of natural background ­conditions in water bodies - a pilot study for EU Water Framework Directive implementation. In: Ruoppa, M. & Karttunen, K. (eds): Typology and ecological classification of lakes and rivers. TemaNord 2002: 566: 133.
• Niinioja, R., Luotonen, H., Hämäläinen, H., Holopainen, A. L., Heitto, L., Mononen, P. & Rämö, A. 2002. State of Lake Sysmä­järvi (Eastern Finland) loaded by mining wastewaters and sewage waters in several decades. Poster presentation. Abstract in Padisak, J. (ed.), Shallow Lakes 2002, International Conference on Limnology of Shallow Lakes, Balatonfüred,Hungary, 25-30 May 2002, Abstracts, Veszprem University Press, p. 170.

2001

• Niinioja, R., Sandman, O., Turkia, J., Huttunen, P. & Tossavainen, T. 2001. The effects of forestry practises on two boreal lakes, North Karelia, Finland. Poster presentation. Abstract in Vuori, K.-M. & Kouki, J. (eds) Conference ”Ecosystem Management in Boreal Forest Landscapes” , 28-30 May, 2001, Koli National Park, Finland. Mimeogr. of North Karelia Regional Env. Centre 25: 87.
• Ohtonen, A., Vuori, K.-M., & Luotonen, H. 2001. Assessing status of small waterbodies in boreal landscapes: Implications for ecosystem management. Poster presentation. Abstract in: Vuori, K.-M. & Kouki, J. (eds). Ecosystem Management in Boreal Forest Landscapes. International Conference, Koli National Park, Finland, May 27-30, 2001. Joensuu, Publication of the North Karelia Regional Environment Centre 25:84.

Muut julkaisut, artikkelit ammattilehdissä ja lehtikirjoitukset

2009

• Luotonen, H., Aho, J., Mononen, P., Niinioja, R., Piipponen, H., Hokkanen, T. J. ja Rämö, A. (toim.) 2009 . Pohjois-Karjalan ympäristön tila 2008. Pohjois-Karjalan ympäristökeskus. Katsaus. 12 s. Sähköinen julkaisu, pdf-muodossa PKAn www-sivuilla, ympäristöntila2008.

2008

• Niinioja, R., Rämö, A. ja Turkka, J. 2008. 10 vuotta Karjalan Pyhäjärven ja Ätäskön näkösyvyyden talkooseurantaa. Suomen Kalastuslehti 1/2008: 21-23.

2007

• Karvonen, R., Järvinen, H. ja Tanskanen, T. 2007. Maatalous. Julk.: Niinioja, R., Lyytikäinen, V. ja Rämö, A. (toim.) 2007. Luonnonvarat ja niiden käyttö. Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 2, 2007. s. 13-15.
• Korhonen, K. T., Kolström, M. ja Eisto, K. 2007. Metsävarat. Julk.: Niinioja, R., Lyytikäinen, V. ja Rämö, A. (toim.) 2007. Luonnonvarat ja niiden käyttö. Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 2, 2007. s. 2-7.
• Kuittinen, J. Riistakannat ja metsästys. Julk.: Niinioja, R., Lyytikäinen, V. ja Rämö, A. (toim.) 2007. Luonnonvarat ja niiden käyttö. Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 2, 2007. 11-12.
• Lyytikäinen, V. ja Kolström, M. 2007. Marjat, sienet ja yrtit. Julk.: Niinioja, R., Lyytikäinen, V. ja Rämö, A. (toim.) 2007. Luonnonvarat ja niiden käyttö. Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 2, 2007. s. 8-10.
• Niinioja, R., Rämö, A., Höytämö, J., Heiskanen, A., Mononen, P. ja Ranta, P. 2007. Vesivarat. Julk.: Niinioja, R., Lyytikäinen, V. ja Rämö, A. (toim.) 2007. Luonnonvarat ja niiden käyttö. Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 2, 2007. s.22-29.
• Pitkänen, P., Ohtonen, A., Kesola, R. ja Luukkonen, E. 2007. Kallio- ja maaperä sekä turvevarat. Julk.: Niinioja, R., Lyytikäinen, V. ja Rämö, A. (toim.) 2007. Luonnonvarat ja niiden käyttö. Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 2, 2007. s. 16-21.  
• Turunen, T. 2007. Kalavarat ja kalastus. Julk.: Niinioja, R., Lyytikäinen, V. ja Rämö, A. (toim.) 2007. Luonnonvarat ja niiden käyttö. Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 2, 2007. s. 30-31.

2005

• Ek, H. 2005. Yleistä maankäytöstä. Julk.: Ek, H., Vartiainen, U. ja Niinioja, R. (toim.), Pohjois-Karjalan ympäristön tila.Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 1 2005. Maankäyttö. s. 2-3.
• Ek, H. 2005. Maankäytön suunnittelu. Julk.: Ek, H., Vartiainen, U. ja Niinioja, R. (toim.), Pohjois-Karjalan ympäristön tila. ­Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 1 2005. Maankäyttö. s. 14-15.
• Ek, H. ja Hämäläinen, J. 2005. Yhdyskuntarakenne. Julk.: Ek, H., Vartiainen, U. ja Niinioja, R. (toim.), Pohjois-Karjalan ympä­ristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 1 2005. Maankäyttö. s. 4-7.
• Järvinen, H., Kemppinen, A., Karvonen, R. ja Niinioja, R. 2005. Maatalous. Julk.: Ek, H., Vartiainen, U. ja Niinioja, R. (toim.), Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 1 2005. Maankäyttö. s. 10.
• Korhonen, K. T. ja Niinioja, R. 2005. Metsävarat. Julk.: Ek, H., Vartiainen, U. ja Niinioja, R. (toim.), Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 1 2005. Maankäyttö. s. 8–9.
• Niinioja, R., Mononen, P. ja Rämö, A. 2005. Vesistöjen käyttökelpoisuusluokitus vuonna 2004 Pohjois-Karjalassa. Pohjois-Karjalan luonto 21: 4–6.
• Vartiainen, U. 2005. Muinaisjäännökset. Julk.: Ek, H., Vartiainen, U. ja Niinioja, R. (toim.), Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 1 2005. Maankäyttö. s. 11.
• Vartiainen, U. 2005. Rakennusperintö. Julk.: Ek, H., Vartiainen, U. ja Niinioja, R. (toim.), Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 1 2005. Maankäyttö. s. 12-13.

2004

• Niinioja, R., Mononen, P. ja Rämö, A. 2004. Pohjois-Karjalan vesistöjen veden laatu 2000-luvun alussa. Esite 4 s. Julkaistu 18.1.2005.

2003

• Niinioja, R. 2003. Vesistöjen seurantaa Pohjois-Karjalassa viranomais- ja kansalaistoimintana sekä Kiihtelysvaaran eteläosan järvien ja lampien veden laadusta. Esitelmä Kiihtelysvaaran eteläiset kylät ry:n tilaisuudessa kansalaisten vesistötarkkailusta 20.3.2003. Raatevaaran koulu, Kiihtelysvaara. Moniste. 4 s. Pohjois-Karjalan ympäristökeskus.
• Niinioja, R. ja Turkka, J. 2003. Näkösyvyyshavainnot vesiensuojelun ja vesistöseurannan keinona: tuloksia vapaaehtoisvoimin tehtävistä näkösyvyysmittauksista Karjalan Pyhäjärvellä ja Ätäsköllä Pohjois-Karjalassa. Suomen kalastuslehti 3/2003: 20-24.

2002

• Hokkanen, T. J. 2002. Biosfääritoimintaa tähtää kestävään kehitykseen. Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen asiakaslehti ­Poimulehti nro 1: 18-21.
• Luotonen, H. & Niinioja, R. 2002. Pohjois-Karjalan ympäristökeskus erikoistunut metsäympäristön tutkimukseen ja seurantaan. Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen asiakaslehti Poimulehti no 1: 15.
• Luhtanen, M. 2002. Ympäristölaboratorio tärkeä osa metsäympäristön tutkimukseen ja seurantaan erikoistumista. Pohjois-­Karjalan ympäristökeskuksen asiakaslehti Poimulehti nro 1: 16-17.
• Niinioja, R. & Mononen, P. 2002. Kirkkaita vesistöjä, arvokkaita kasvillisuustyypeiltään - Naturakohteet Kuorinka ja Karjalan Pyhäjärvi. Teksti Maailman vesipäivä 22.3.2002 esitteessä. Suomen ympäristökeskus ja Pohjois-Karjalan ympäristökeskus.
• Uotila, I. & Luotonen, H. 2002. Suurpetohanke käynnistyi Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksessa. Eräviesti 2002, s. 7.

2001

• Lohilahti, H. 2001. Menneisyyden poluilla: Kolin Herajärven perinnepolku. Joensuu, Pohjois-Karjalan ympäristökeskus ja Metsäntutkimuslaitos. 48 s.

2000

• Ahtiainen, M. 2000. Pohjois-Karjalan ympäristön tila kohentunut. Ympäristökeskus toiminut viisi vuotta. Alakerta-artikkeli sanomalehti Karjalaisessa 5.3.2000.

Toimitustyöt

2009

• Niinioja, R. (toim.) 2009. Ympäristöhallinnon yhteinen seurantaohjelma 2009−2012.Toteutus Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen alueella. Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen raportteja 5/2009. 38 s. Vain verkkojulkaisuna: www.ymparisto.fi / Pohjois-Karjala / palvelut ja tuotteet / Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen julkaisut / ao. julkaisu.

2007

• Niinioja, R. (toim.) 2007. Ympäristön seurantaohjelma vuosille 2006-2008. Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen raportteja 2. 56 s.

2006

• Niinioja, R. ja Rämö, A. (toim.) 2006. Hietajärven alue ­ympäristön seurannan helmi Pohjois-Karjalassa. Suomen ympäristö 59. 68 s.

2005

• Alm, J., Niinioja, R., Aho, J. ja Latja, R. (toim.) 2005. Ilma­kehän muutos ja kasvihuonekaasupäästöt. Pohjois-Karjalassa Joensuussa 6.10.2004 pidetyn seminaarin esitelmät. Alueelliset ympäristöjulkaisut 375. 51 s.
• Ek, H., Vartiainen, U. ja Niinioja, R. (toim.) 2005. Pohjois-Karjalan ympäristön tila. Ympäristön seurantatietoa Pohjois-Karjalasta nro 1 2005. Maankäyttö. 16 s.

2004

• Niinioja, R. ja Luotonen, H. (toim.) 2004. Alueellinen ympäristön tilan seuranta Pohjois-Karjalassa. Seurantaseminaarin esitelmät 08.10.2003, Joensuu. Alueelliset ympäristöjulkaisut 331. 77 s.

2003

• Luotonen, H. ja Lyytikäinen, V. (toim.) 2003. Mitä tapahtui vuonna 2002…Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen tutkimus, ­seuranta ja ympäristötietoisuusyksikön vuosikertomus. Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen monisteita 32. 56 s.
• Niinioja, R. (toim.) 2003. Ympäristön seurantaohjelma vuosille 2003-2005. Pohjois-Karjalan ympäristökeskus. Alueelliset ympäristöjulkaisut 305. 57 s.

2001

• Hämäläinen, J., Luotonen, H. & Vänskä, T. (eds) 2001. Paths to the Future. The environmental programme of North Karelia until 2010. Content and primary goals. 8 pp. North Karelia Regional Environment Centre.

2000

• Hämäläinen, J., Luotonen, H. & Vänskä, T. (toim.) 2000. Polkuja tulevaisuuteen. Pohjois-Karjalan ympäristöohjelma vuoteen 2010. Sisältö ja päätavoitteet. 8 s. Pohjois-Karjalan ympäristökeskus.
• Luotonen, H., Mononen, P., Eisto, I., Hämäläinen J., Kokkonen, J. & Vänskä, T. (toim.) 2000. Polkuja tulevaisuuteen. Pohjois-­Karjalan ympäristöohjelma vuoteen 2010. Joensuu, Pohjois-Karjalan ympäristökeskus. 95 s.
• Niinioja, R. (toim.) 2000. Pohjois-Karjalan ympäristökeskuksen ympäristönseurannan ohjelma vuosille 2000-2002. Alueelliset ympäristöjulkaisut 196. 51 s.